Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6R1

Itga10, Integrin, alpha 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga10E9Q6R1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga10E9Q6R1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga10E9Q6R1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga10E9Q6R1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga10E9Q6R1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga10E9Q6R1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga10E9Q6R1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga10E9Q6R1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga10E9Q6R1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga10E9Q6R1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga10E9Q6R1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Itga10E9Q6R1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Itga10E9Q6R1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Itga10E9Q6R1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga10E9Q6R1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms