Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BC005561E9Q5E2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BC005561E9Q5E2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
BC005561E9Q5E2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BC005561E9Q5E2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
BC005561E9Q5E2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
BC005561E9Q5E2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
BC005561E9Q5E2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BC005561E9Q5E2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BC005561E9Q5E2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BC005561E9Q5E2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BC005561E9Q5E2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BC005561E9Q5E2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BC005561E9Q5E2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BC005561E9Q5E2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
BC005561E9Q5E2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
BC005561E9Q5E2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
BC005561E9Q5E2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
BC005561E9Q5E2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
BC005561E9Q5E2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
BC005561E9Q5E2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
BC005561E9Q5E2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
BC005561E9Q5E2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
BC005561E9Q5E2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
BC005561E9Q5E2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
BC005561E9Q5E2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
BC005561E9Q5E2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
BC005561E9Q5E2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
BC005561E9Q5E2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
BC005561E9Q5E2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
BC005561E9Q5E2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BC005561E9Q5E2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BC005561E9Q5E2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BC005561E9Q5E2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BC005561E9Q5E2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BC005561E9Q5E2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BC005561E9Q5E2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BC005561E9Q5E2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BC005561E9Q5E2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BC005561E9Q5E2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
BC005561E9Q5E2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BC005561E9Q5E2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BC005561E9Q5E2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BC005561E9Q5E2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BC005561E9Q5E2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BC005561E9Q5E2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
BC005561E9Q5E2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
BC005561E9Q5E2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BC005561E9Q5E2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BC005561E9Q5E2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
BC005561E9Q5E2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BC005561E9Q5E2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
BC005561E9Q5E2 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
BC005561E9Q5E2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
BC005561E9Q5E2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
BC005561E9Q5E2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
BC005561E9Q5E2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
BC005561E9Q5E2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
BC005561E9Q5E2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
BC005561E9Q5E2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
BC005561E9Q5E2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
BC005561E9Q5E2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
BC005561E9Q5E2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
BC005561E9Q5E2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.12
BC005561E9Q5E2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
BC005561E9Q5E2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
BC005561E9Q5E2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
BC005561E9Q5E2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
BC005561E9Q5E2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
BC005561E9Q5E2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
BC005561E9Q5E2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
BC005561E9Q5E2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
BC005561E9Q5E2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
BC005561E9Q5E2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
BC005561E9Q5E2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
BC005561E9Q5E2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
BC005561E9Q5E2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
BC005561E9Q5E2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BC005561E9Q5E2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
BC005561E9Q5E2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
BC005561E9Q5E2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BC005561E9Q5E2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
BC005561E9Q5E2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
BC005561E9Q5E2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
BC005561E9Q5E2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
BC005561E9Q5E2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
BC005561E9Q5E2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
BC005561E9Q5E2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
BC005561E9Q5E2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
BC005561E9Q5E2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
BC005561E9Q5E2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
BC005561E9Q5E2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BC005561E9Q5E2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
BC005561E9Q5E2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
BC005561E9Q5E2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
BC005561E9Q5E2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
BC005561E9Q5E2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BC005561E9Q5E2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
BC005561E9Q5E2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BC005561E9Q5E2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms