Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
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