Protein–RNA interactions for Protein: E9Q236

Abcc4, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc4E9Q236 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcc4E9Q236 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcc4E9Q236 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcc4E9Q236 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcc4E9Q236 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcc4E9Q236 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcc4E9Q236 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcc4E9Q236 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcc4E9Q236 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcc4E9Q236 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcc4E9Q236 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcc4E9Q236 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcc4E9Q236 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcc4E9Q236 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcc4E9Q236 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcc4E9Q236 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcc4E9Q236 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcc4E9Q236 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcc4E9Q236 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcc4E9Q236 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcc4E9Q236 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcc4E9Q236 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcc4E9Q236 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcc4E9Q236 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcc4E9Q236 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcc4E9Q236 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcc4E9Q236 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcc4E9Q236 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcc4E9Q236 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcc4E9Q236 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Abcc4E9Q236 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcc4E9Q236 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcc4E9Q236 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcc4E9Q236 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcc4E9Q236 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcc4E9Q236 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcc4E9Q236 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcc4E9Q236 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcc4E9Q236 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcc4E9Q236 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcc4E9Q236 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcc4E9Q236 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcc4E9Q236 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcc4E9Q236 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcc4E9Q236 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcc4E9Q236 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcc4E9Q236 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcc4E9Q236 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcc4E9Q236 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcc4E9Q236 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcc4E9Q236 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcc4E9Q236 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcc4E9Q236 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcc4E9Q236 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcc4E9Q236 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcc4E9Q236 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcc4E9Q236 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcc4E9Q236 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcc4E9Q236 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcc4E9Q236 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcc4E9Q236 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcc4E9Q236 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcc4E9Q236 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcc4E9Q236 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcc4E9Q236 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcc4E9Q236 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcc4E9Q236 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcc4E9Q236 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcc4E9Q236 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcc4E9Q236 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcc4E9Q236 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcc4E9Q236 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcc4E9Q236 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcc4E9Q236 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcc4E9Q236 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcc4E9Q236 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcc4E9Q236 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcc4E9Q236 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcc4E9Q236 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcc4E9Q236 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcc4E9Q236 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcc4E9Q236 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcc4E9Q236 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcc4E9Q236 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcc4E9Q236 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcc4E9Q236 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcc4E9Q236 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcc4E9Q236 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcc4E9Q236 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcc4E9Q236 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcc4E9Q236 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcc4E9Q236 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcc4E9Q236 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcc4E9Q236 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcc4E9Q236 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcc4E9Q236 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcc4E9Q236 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcc4E9Q236 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcc4E9Q236 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcc4E9Q236 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms