Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
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