Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Myo5cE9Q1F5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Myo5cE9Q1F5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Myo5cE9Q1F5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Myo5cE9Q1F5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Myo5cE9Q1F5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Myo5cE9Q1F5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Myo5cE9Q1F5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Myo5cE9Q1F5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Myo5cE9Q1F5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Myo5cE9Q1F5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Myo5cE9Q1F5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Myo5cE9Q1F5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Myo5cE9Q1F5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Myo5cE9Q1F5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Myo5cE9Q1F5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Myo5cE9Q1F5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Myo5cE9Q1F5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Myo5cE9Q1F5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Myo5cE9Q1F5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Myo5cE9Q1F5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Myo5cE9Q1F5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Myo5cE9Q1F5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Myo5cE9Q1F5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Myo5cE9Q1F5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Myo5cE9Q1F5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Myo5cE9Q1F5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Myo5cE9Q1F5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Myo5cE9Q1F5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Myo5cE9Q1F5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Myo5cE9Q1F5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Myo5cE9Q1F5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Myo5cE9Q1F5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Myo5cE9Q1F5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Myo5cE9Q1F5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Myo5cE9Q1F5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Myo5cE9Q1F5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Myo5cE9Q1F5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Myo5cE9Q1F5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Myo5cE9Q1F5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Myo5cE9Q1F5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Myo5cE9Q1F5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Myo5cE9Q1F5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Myo5cE9Q1F5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Myo5cE9Q1F5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Myo5cE9Q1F5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Myo5cE9Q1F5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Myo5cE9Q1F5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Myo5cE9Q1F5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Myo5cE9Q1F5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Myo5cE9Q1F5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Myo5cE9Q1F5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Myo5cE9Q1F5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Myo5cE9Q1F5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Myo5cE9Q1F5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Myo5cE9Q1F5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Myo5cE9Q1F5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Myo5cE9Q1F5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Myo5cE9Q1F5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Myo5cE9Q1F5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Myo5cE9Q1F5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Myo5cE9Q1F5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Myo5cE9Q1F5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Myo5cE9Q1F5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Myo5cE9Q1F5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Myo5cE9Q1F5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Myo5cE9Q1F5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Myo5cE9Q1F5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Myo5cE9Q1F5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Myo5cE9Q1F5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Myo5cE9Q1F5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Myo5cE9Q1F5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Myo5cE9Q1F5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Myo5cE9Q1F5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Myo5cE9Q1F5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Myo5cE9Q1F5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Myo5cE9Q1F5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Myo5cE9Q1F5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Myo5cE9Q1F5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Myo5cE9Q1F5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Myo5cE9Q1F5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Myo5cE9Q1F5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Myo5cE9Q1F5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Myo5cE9Q1F5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Myo5cE9Q1F5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Myo5cE9Q1F5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Myo5cE9Q1F5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Myo5cE9Q1F5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Myo5cE9Q1F5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Myo5cE9Q1F5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Myo5cE9Q1F5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Myo5cE9Q1F5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Myo5cE9Q1F5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Myo5cE9Q1F5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Myo5cE9Q1F5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Myo5cE9Q1F5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Myo5cE9Q1F5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Myo5cE9Q1F5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Myo5cE9Q1F5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Myo5cE9Q1F5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms