Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms