Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdr1E9Q0B4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdr1E9Q0B4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdr1E9Q0B4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdr1E9Q0B4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdr1E9Q0B4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdr1E9Q0B4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdr1E9Q0B4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdr1E9Q0B4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdr1E9Q0B4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdr1E9Q0B4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdr1E9Q0B4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdr1E9Q0B4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdr1E9Q0B4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdr1E9Q0B4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdr1E9Q0B4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdr1E9Q0B4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdr1E9Q0B4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdr1E9Q0B4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdr1E9Q0B4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdr1E9Q0B4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdr1E9Q0B4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdr1E9Q0B4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdr1E9Q0B4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdr1E9Q0B4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdr1E9Q0B4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdr1E9Q0B4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdr1E9Q0B4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdr1E9Q0B4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdr1E9Q0B4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdr1E9Q0B4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdr1E9Q0B4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdr1E9Q0B4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdr1E9Q0B4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdr1E9Q0B4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdr1E9Q0B4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdr1E9Q0B4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdr1E9Q0B4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdr1E9Q0B4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdr1E9Q0B4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdr1E9Q0B4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms