Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

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Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3095E9Q058 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3095E9Q058 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3095E9Q058 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3095E9Q058 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3095E9Q058 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3095E9Q058 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3095E9Q058 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm3095E9Q058 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm3095E9Q058 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm3095E9Q058 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3095E9Q058 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3095E9Q058 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3095E9Q058 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3095E9Q058 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3095E9Q058 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3095E9Q058 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3095E9Q058 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3095E9Q058 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3095E9Q058 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3095E9Q058 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3095E9Q058 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3095E9Q058 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3095E9Q058 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3095E9Q058 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3095E9Q058 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3095E9Q058 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3095E9Q058 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3095E9Q058 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3095E9Q058 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3095E9Q058 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3095E9Q058 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3095E9Q058 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3095E9Q058 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3095E9Q058 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3095E9Q058 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3095E9Q058 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3095E9Q058 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3095E9Q058 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3095E9Q058 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3095E9Q058 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3095E9Q058 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3095E9Q058 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3095E9Q058 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3095E9Q058 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3095E9Q058 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3095E9Q058 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3095E9Q058 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3095E9Q058 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3095E9Q058 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3095E9Q058 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3095E9Q058 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3095E9Q058 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3095E9Q058 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3095E9Q058 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3095E9Q058 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3095E9Q058 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3095E9Q058 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3095E9Q058 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3095E9Q058 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3095E9Q058 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3095E9Q058 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3095E9Q058 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3095E9Q058 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3095E9Q058 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3095E9Q058 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3095E9Q058 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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