Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms