Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Scaf11E9PZM7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Scaf11E9PZM7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Scaf11E9PZM7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Scaf11E9PZM7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Scaf11E9PZM7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Scaf11E9PZM7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Scaf11E9PZM7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Scaf11E9PZM7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Scaf11E9PZM7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Scaf11E9PZM7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Scaf11E9PZM7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Scaf11E9PZM7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Scaf11E9PZM7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Scaf11E9PZM7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Scaf11E9PZM7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Scaf11E9PZM7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Scaf11E9PZM7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Scaf11E9PZM7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Scaf11E9PZM7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Scaf11E9PZM7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Scaf11E9PZM7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Scaf11E9PZM7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Scaf11E9PZM7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Scaf11E9PZM7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Scaf11E9PZM7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Scaf11E9PZM7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Scaf11E9PZM7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Scaf11E9PZM7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Scaf11E9PZM7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Scaf11E9PZM7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Scaf11E9PZM7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Scaf11E9PZM7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Scaf11E9PZM7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Scaf11E9PZM7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Scaf11E9PZM7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Scaf11E9PZM7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Scaf11E9PZM7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Scaf11E9PZM7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Scaf11E9PZM7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Scaf11E9PZM7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Scaf11E9PZM7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Scaf11E9PZM7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Scaf11E9PZM7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Scaf11E9PZM7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Scaf11E9PZM7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Scaf11E9PZM7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Scaf11E9PZM7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Scaf11E9PZM7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Scaf11E9PZM7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Scaf11E9PZM7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Scaf11E9PZM7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Scaf11E9PZM7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Scaf11E9PZM7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Scaf11E9PZM7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Scaf11E9PZM7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Scaf11E9PZM7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Scaf11E9PZM7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Scaf11E9PZM7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Scaf11E9PZM7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Scaf11E9PZM7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Scaf11E9PZM7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Scaf11E9PZM7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Scaf11E9PZM7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Scaf11E9PZM7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Scaf11E9PZM7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Scaf11E9PZM7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Scaf11E9PZM7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Scaf11E9PZM7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Scaf11E9PZM7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Scaf11E9PZM7 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Scaf11E9PZM7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Scaf11E9PZM7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Scaf11E9PZM7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Scaf11E9PZM7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Scaf11E9PZM7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Scaf11E9PZM7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Scaf11E9PZM7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Scaf11E9PZM7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Scaf11E9PZM7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Scaf11E9PZM7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Scaf11E9PZM7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Scaf11E9PZM7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Scaf11E9PZM7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Scaf11E9PZM7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Scaf11E9PZM7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Scaf11E9PZM7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Scaf11E9PZM7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Scaf11E9PZM7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Scaf11E9PZM7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Scaf11E9PZM7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Scaf11E9PZM7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Scaf11E9PZM7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Scaf11E9PZM7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Scaf11E9PZM7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Scaf11E9PZM7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Scaf11E9PZM7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Scaf11E9PZM7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Scaf11E9PZM7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Scaf11E9PZM7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms