Protein–RNA interactions for Protein: E9PYF4

Lmo7, LIM domain only 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo7E9PYF4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lmo7E9PYF4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lmo7E9PYF4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Lmo7E9PYF4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Lmo7E9PYF4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lmo7E9PYF4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lmo7E9PYF4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lmo7E9PYF4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lmo7E9PYF4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lmo7E9PYF4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Lmo7E9PYF4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lmo7E9PYF4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lmo7E9PYF4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lmo7E9PYF4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lmo7E9PYF4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lmo7E9PYF4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lmo7E9PYF4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Lmo7E9PYF4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lmo7E9PYF4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lmo7E9PYF4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lmo7E9PYF4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lmo7E9PYF4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lmo7E9PYF4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lmo7E9PYF4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lmo7E9PYF4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lmo7E9PYF4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Lmo7E9PYF4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lmo7E9PYF4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Lmo7E9PYF4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Lmo7E9PYF4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lmo7E9PYF4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lmo7E9PYF4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Lmo7E9PYF4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lmo7E9PYF4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lmo7E9PYF4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lmo7E9PYF4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lmo7E9PYF4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lmo7E9PYF4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lmo7E9PYF4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lmo7E9PYF4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Lmo7E9PYF4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lmo7E9PYF4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lmo7E9PYF4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lmo7E9PYF4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lmo7E9PYF4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lmo7E9PYF4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lmo7E9PYF4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Lmo7E9PYF4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Lmo7E9PYF4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lmo7E9PYF4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Lmo7E9PYF4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lmo7E9PYF4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lmo7E9PYF4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lmo7E9PYF4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lmo7E9PYF4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lmo7E9PYF4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lmo7E9PYF4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lmo7E9PYF4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lmo7E9PYF4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lmo7E9PYF4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lmo7E9PYF4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lmo7E9PYF4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lmo7E9PYF4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lmo7E9PYF4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lmo7E9PYF4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lmo7E9PYF4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lmo7E9PYF4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lmo7E9PYF4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lmo7E9PYF4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lmo7E9PYF4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Lmo7E9PYF4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lmo7E9PYF4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lmo7E9PYF4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lmo7E9PYF4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Lmo7E9PYF4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lmo7E9PYF4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lmo7E9PYF4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lmo7E9PYF4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lmo7E9PYF4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Lmo7E9PYF4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lmo7E9PYF4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Lmo7E9PYF4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lmo7E9PYF4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lmo7E9PYF4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lmo7E9PYF4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lmo7E9PYF4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lmo7E9PYF4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lmo7E9PYF4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lmo7E9PYF4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lmo7E9PYF4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Lmo7E9PYF4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Lmo7E9PYF4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Lmo7E9PYF4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Lmo7E9PYF4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Lmo7E9PYF4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Lmo7E9PYF4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lmo7E9PYF4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lmo7E9PYF4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lmo7E9PYF4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lmo7E9PYF4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms