Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srp54bE9PXC0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 183.2 ms