Protein–RNA interactions for Protein: E9PV98

Trim5, Tripartite motif-containing 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim5E9PV98 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim5E9PV98 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim5E9PV98 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim5E9PV98 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim5E9PV98 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim5E9PV98 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim5E9PV98 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim5E9PV98 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim5E9PV98 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim5E9PV98 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim5E9PV98 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim5E9PV98 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim5E9PV98 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim5E9PV98 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim5E9PV98 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim5E9PV98 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim5E9PV98 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim5E9PV98 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim5E9PV98 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim5E9PV98 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim5E9PV98 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim5E9PV98 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim5E9PV98 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim5E9PV98 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim5E9PV98 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim5E9PV98 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim5E9PV98 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trim5E9PV98 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trim5E9PV98 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trim5E9PV98 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trim5E9PV98 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim5E9PV98 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim5E9PV98 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim5E9PV98 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim5E9PV98 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim5E9PV98 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim5E9PV98 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim5E9PV98 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim5E9PV98 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim5E9PV98 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim5E9PV98 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim5E9PV98 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim5E9PV98 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim5E9PV98 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim5E9PV98 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim5E9PV98 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim5E9PV98 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim5E9PV98 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim5E9PV98 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim5E9PV98 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim5E9PV98 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim5E9PV98 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim5E9PV98 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim5E9PV98 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim5E9PV98 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim5E9PV98 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim5E9PV98 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim5E9PV98 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim5E9PV98 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim5E9PV98 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim5E9PV98 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim5E9PV98 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim5E9PV98 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim5E9PV98 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim5E9PV98 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim5E9PV98 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim5E9PV98 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim5E9PV98 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim5E9PV98 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim5E9PV98 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim5E9PV98 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim5E9PV98 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim5E9PV98 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim5E9PV98 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim5E9PV98 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim5E9PV98 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim5E9PV98 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim5E9PV98 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim5E9PV98 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim5E9PV98 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim5E9PV98 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim5E9PV98 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim5E9PV98 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim5E9PV98 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim5E9PV98 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim5E9PV98 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim5E9PV98 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim5E9PV98 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim5E9PV98 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim5E9PV98 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim5E9PV98 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim5E9PV98 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim5E9PV98 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim5E9PV98 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim5E9PV98 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim5E9PV98 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim5E9PV98 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim5E9PV98 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim5E9PV98 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim5E9PV98 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms