Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5T1

Ccdc78, Coiled-coil domain-containing protein 78, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc78D3Z5T1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc78D3Z5T1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc78D3Z5T1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc78D3Z5T1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc78D3Z5T1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc78D3Z5T1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc78D3Z5T1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc78D3Z5T1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc78D3Z5T1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc78D3Z5T1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc78D3Z5T1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc78D3Z5T1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc78D3Z5T1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc78D3Z5T1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc78D3Z5T1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc78D3Z5T1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc78D3Z5T1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc78D3Z5T1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc78D3Z5T1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc78D3Z5T1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc78D3Z5T1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc78D3Z5T1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc78D3Z5T1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc78D3Z5T1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc78D3Z5T1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc78D3Z5T1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc78D3Z5T1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc78D3Z5T1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc78D3Z5T1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc78D3Z5T1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc78D3Z5T1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc78D3Z5T1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc78D3Z5T1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc78D3Z5T1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc78D3Z5T1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc78D3Z5T1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc78D3Z5T1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc78D3Z5T1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc78D3Z5T1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc78D3Z5T1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc78D3Z5T1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc78D3Z5T1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc78D3Z5T1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc78D3Z5T1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc78D3Z5T1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc78D3Z5T1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc78D3Z5T1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc78D3Z5T1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc78D3Z5T1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc78D3Z5T1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc78D3Z5T1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc78D3Z5T1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc78D3Z5T1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc78D3Z5T1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc78D3Z5T1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc78D3Z5T1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc78D3Z5T1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc78D3Z5T1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc78D3Z5T1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc78D3Z5T1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc78D3Z5T1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc78D3Z5T1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc78D3Z5T1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc78D3Z5T1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc78D3Z5T1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc78D3Z5T1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc78D3Z5T1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc78D3Z5T1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc78D3Z5T1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc78D3Z5T1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc78D3Z5T1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc78D3Z5T1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc78D3Z5T1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc78D3Z5T1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc78D3Z5T1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc78D3Z5T1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc78D3Z5T1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc78D3Z5T1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc78D3Z5T1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc78D3Z5T1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc78D3Z5T1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc78D3Z5T1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc78D3Z5T1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc78D3Z5T1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc78D3Z5T1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc78D3Z5T1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc78D3Z5T1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc78D3Z5T1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc78D3Z5T1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc78D3Z5T1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc78D3Z5T1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc78D3Z5T1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc78D3Z5T1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc78D3Z5T1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc78D3Z5T1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc78D3Z5T1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc78D3Z5T1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc78D3Z5T1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc78D3Z5T1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc78D3Z5T1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms