Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms