Protein–RNA interactions for Protein: D3YV89

Mmp27, Matrix metalloproteinase, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp27D3YV89 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp27D3YV89 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp27D3YV89 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp27D3YV89 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp27D3YV89 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp27D3YV89 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp27D3YV89 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp27D3YV89 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp27D3YV89 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp27D3YV89 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp27D3YV89 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp27D3YV89 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp27D3YV89 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp27D3YV89 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp27D3YV89 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp27D3YV89 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp27D3YV89 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp27D3YV89 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp27D3YV89 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp27D3YV89 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp27D3YV89 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp27D3YV89 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp27D3YV89 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp27D3YV89 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp27D3YV89 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp27D3YV89 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp27D3YV89 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp27D3YV89 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp27D3YV89 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp27D3YV89 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp27D3YV89 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp27D3YV89 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp27D3YV89 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp27D3YV89 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp27D3YV89 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp27D3YV89 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp27D3YV89 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp27D3YV89 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp27D3YV89 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp27D3YV89 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp27D3YV89 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp27D3YV89 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp27D3YV89 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp27D3YV89 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp27D3YV89 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp27D3YV89 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp27D3YV89 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp27D3YV89 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp27D3YV89 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms