Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC1

Trappc11, Trafficking protein particle complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc11B2RXC1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms