Protein–RNA interactions for Protein: B2RW27

1700018F24Rik, 1700018F24Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018F24RikB2RW27 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms