Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms