Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Apol7aB2RT54 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms