Protein–RNA interactions for Protein: B2RQY6

BC035947, BC035947 protein, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035947B2RQY6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BC035947B2RQY6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BC035947B2RQY6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BC035947B2RQY6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms