Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC2

Usp42, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp42B2RQC2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp42B2RQC2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp42B2RQC2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp42B2RQC2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp42B2RQC2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp42B2RQC2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp42B2RQC2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp42B2RQC2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp42B2RQC2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp42B2RQC2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp42B2RQC2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp42B2RQC2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp42B2RQC2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp42B2RQC2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp42B2RQC2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp42B2RQC2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp42B2RQC2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp42B2RQC2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp42B2RQC2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp42B2RQC2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp42B2RQC2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp42B2RQC2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp42B2RQC2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp42B2RQC2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp42B2RQC2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp42B2RQC2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp42B2RQC2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp42B2RQC2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp42B2RQC2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp42B2RQC2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp42B2RQC2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp42B2RQC2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp42B2RQC2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp42B2RQC2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp42B2RQC2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp42B2RQC2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp42B2RQC2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp42B2RQC2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp42B2RQC2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp42B2RQC2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp42B2RQC2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp42B2RQC2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp42B2RQC2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Usp42B2RQC2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp42B2RQC2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp42B2RQC2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp42B2RQC2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp42B2RQC2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp42B2RQC2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp42B2RQC2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp42B2RQC2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp42B2RQC2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp42B2RQC2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp42B2RQC2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp42B2RQC2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp42B2RQC2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp42B2RQC2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp42B2RQC2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp42B2RQC2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp42B2RQC2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp42B2RQC2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp42B2RQC2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp42B2RQC2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp42B2RQC2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp42B2RQC2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp42B2RQC2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp42B2RQC2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp42B2RQC2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp42B2RQC2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp42B2RQC2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp42B2RQC2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp42B2RQC2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp42B2RQC2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp42B2RQC2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp42B2RQC2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp42B2RQC2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp42B2RQC2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp42B2RQC2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp42B2RQC2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp42B2RQC2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp42B2RQC2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp42B2RQC2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp42B2RQC2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp42B2RQC2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp42B2RQC2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp42B2RQC2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp42B2RQC2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp42B2RQC2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp42B2RQC2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp42B2RQC2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp42B2RQC2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp42B2RQC2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp42B2RQC2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp42B2RQC2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp42B2RQC2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp42B2RQC2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp42B2RQC2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp42B2RQC2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp42B2RQC2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp42B2RQC2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms