Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Uhrf1bp1B2KF50 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Uhrf1bp1B2KF50 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Uhrf1bp1B2KF50 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Uhrf1bp1B2KF50 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Uhrf1bp1B2KF50 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Uhrf1bp1B2KF50 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1B2KF50 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1B2KF50 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1B2KF50 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1B2KF50 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1B2KF50 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1B2KF50 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1B2KF50 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1B2KF50 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1B2KF50 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1B2KF50 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1B2KF50 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1B2KF50 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1B2KF50 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1B2KF50 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1B2KF50 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1B2KF50 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1B2KF50 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1B2KF50 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1B2KF50 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1B2KF50 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1B2KF50 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1B2KF50 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1B2KF50 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1B2KF50 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1B2KF50 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1B2KF50 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1B2KF50 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1B2KF50 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1B2KF50 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1B2KF50 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1B2KF50 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1B2KF50 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1B2KF50 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1B2KF50 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1B2KF50 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1B2KF50 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1B2KF50 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1B2KF50 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1B2KF50 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1B2KF50 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1B2KF50 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1B2KF50 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1B2KF50 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1B2KF50 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1B2KF50 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1B2KF50 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1B2KF50 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1B2KF50 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1B2KF50 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1B2KF50 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1B2KF50 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1B2KF50 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1B2KF50 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1B2KF50 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1B2KF50 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Uhrf1bp1B2KF50 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Uhrf1bp1B2KF50 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Uhrf1bp1B2KF50 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Uhrf1bp1B2KF50 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Uhrf1bp1B2KF50 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Uhrf1bp1B2KF50 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Uhrf1bp1B2KF50 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Uhrf1bp1B2KF50 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Uhrf1bp1B2KF50 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Uhrf1bp1B2KF50 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Uhrf1bp1B2KF50 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Uhrf1bp1B2KF50 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Uhrf1bp1B2KF50 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Uhrf1bp1B2KF50 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Uhrf1bp1B2KF50 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Uhrf1bp1B2KF50 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Uhrf1bp1B2KF50 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Uhrf1bp1B2KF50 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Uhrf1bp1B2KF50 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Uhrf1bp1B2KF50 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Uhrf1bp1B2KF50 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Uhrf1bp1B2KF50 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Uhrf1bp1B2KF50 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Uhrf1bp1B2KF50 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms