Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms