Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H60cB1B213 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
H60cB1B213 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
H60cB1B213 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
H60cB1B213 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
H60cB1B213 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H60cB1B213 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
H60cB1B213 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H60cB1B213 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H60cB1B213 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H60cB1B213 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H60cB1B213 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
H60cB1B213 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H60cB1B213 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H60cB1B213 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms