Protein–RNA interactions for Protein: B1AYL1

Scn7a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn7aB1AYL1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scn7aB1AYL1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scn7aB1AYL1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scn7aB1AYL1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scn7aB1AYL1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scn7aB1AYL1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scn7aB1AYL1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scn7aB1AYL1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scn7aB1AYL1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scn7aB1AYL1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scn7aB1AYL1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scn7aB1AYL1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Scn7aB1AYL1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Scn7aB1AYL1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scn7aB1AYL1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scn7aB1AYL1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scn7aB1AYL1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Scn7aB1AYL1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scn7aB1AYL1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Scn7aB1AYL1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scn7aB1AYL1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Scn7aB1AYL1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scn7aB1AYL1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scn7aB1AYL1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scn7aB1AYL1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scn7aB1AYL1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scn7aB1AYL1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scn7aB1AYL1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scn7aB1AYL1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scn7aB1AYL1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scn7aB1AYL1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scn7aB1AYL1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scn7aB1AYL1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scn7aB1AYL1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scn7aB1AYL1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scn7aB1AYL1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scn7aB1AYL1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scn7aB1AYL1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scn7aB1AYL1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scn7aB1AYL1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scn7aB1AYL1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scn7aB1AYL1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scn7aB1AYL1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scn7aB1AYL1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scn7aB1AYL1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scn7aB1AYL1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scn7aB1AYL1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scn7aB1AYL1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scn7aB1AYL1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Scn7aB1AYL1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scn7aB1AYL1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scn7aB1AYL1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scn7aB1AYL1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scn7aB1AYL1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scn7aB1AYL1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scn7aB1AYL1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scn7aB1AYL1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scn7aB1AYL1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scn7aB1AYL1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scn7aB1AYL1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scn7aB1AYL1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scn7aB1AYL1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scn7aB1AYL1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scn7aB1AYL1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scn7aB1AYL1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Scn7aB1AYL1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scn7aB1AYL1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scn7aB1AYL1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scn7aB1AYL1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Scn7aB1AYL1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scn7aB1AYL1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scn7aB1AYL1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scn7aB1AYL1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Scn7aB1AYL1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Scn7aB1AYL1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Scn7aB1AYL1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Scn7aB1AYL1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scn7aB1AYL1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scn7aB1AYL1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scn7aB1AYL1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scn7aB1AYL1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scn7aB1AYL1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scn7aB1AYL1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scn7aB1AYL1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scn7aB1AYL1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scn7aB1AYL1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scn7aB1AYL1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scn7aB1AYL1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scn7aB1AYL1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scn7aB1AYL1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scn7aB1AYL1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scn7aB1AYL1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scn7aB1AYL1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scn7aB1AYL1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scn7aB1AYL1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scn7aB1AYL1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scn7aB1AYL1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scn7aB1AYL1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scn7aB1AYL1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scn7aB1AYL1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms