Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB3

Gm438, MCG65768, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm438B1ASB3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm438B1ASB3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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