Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grik3B1AS29 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms