Protein–RNA interactions for Protein: A6PWV5

Arid3c, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid3cA6PWV5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Arid3cA6PWV5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Arid3cA6PWV5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Arid3cA6PWV5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Arid3cA6PWV5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Arid3cA6PWV5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Arid3cA6PWV5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Arid3cA6PWV5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Arid3cA6PWV5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Arid3cA6PWV5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Arid3cA6PWV5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Arid3cA6PWV5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Arid3cA6PWV5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Arid3cA6PWV5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Arid3cA6PWV5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Arid3cA6PWV5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Arid3cA6PWV5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Arid3cA6PWV5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Arid3cA6PWV5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Arid3cA6PWV5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Arid3cA6PWV5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Arid3cA6PWV5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Arid3cA6PWV5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Arid3cA6PWV5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Arid3cA6PWV5 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Arid3cA6PWV5 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Arid3cA6PWV5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Arid3cA6PWV5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Arid3cA6PWV5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Arid3cA6PWV5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Arid3cA6PWV5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Arid3cA6PWV5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Arid3cA6PWV5 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Arid3cA6PWV5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Arid3cA6PWV5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Arid3cA6PWV5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Arid3cA6PWV5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Arid3cA6PWV5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Arid3cA6PWV5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Arid3cA6PWV5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Arid3cA6PWV5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Arid3cA6PWV5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Arid3cA6PWV5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Arid3cA6PWV5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Arid3cA6PWV5 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Arid3cA6PWV5 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Arid3cA6PWV5 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Arid3cA6PWV5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Arid3cA6PWV5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Arid3cA6PWV5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Arid3cA6PWV5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Arid3cA6PWV5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Arid3cA6PWV5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Arid3cA6PWV5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Arid3cA6PWV5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Arid3cA6PWV5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Arid3cA6PWV5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Arid3cA6PWV5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Arid3cA6PWV5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Arid3cA6PWV5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Arid3cA6PWV5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Arid3cA6PWV5 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Arid3cA6PWV5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Arid3cA6PWV5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Arid3cA6PWV5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Arid3cA6PWV5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Arid3cA6PWV5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Arid3cA6PWV5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Arid3cA6PWV5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Arid3cA6PWV5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Arid3cA6PWV5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Arid3cA6PWV5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Arid3cA6PWV5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Arid3cA6PWV5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Arid3cA6PWV5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Arid3cA6PWV5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Arid3cA6PWV5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Arid3cA6PWV5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Arid3cA6PWV5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Arid3cA6PWV5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Arid3cA6PWV5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Arid3cA6PWV5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Arid3cA6PWV5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Arid3cA6PWV5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Arid3cA6PWV5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Arid3cA6PWV5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Arid3cA6PWV5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Arid3cA6PWV5 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Arid3cA6PWV5 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Arid3cA6PWV5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Arid3cA6PWV5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Arid3cA6PWV5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Arid3cA6PWV5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Arid3cA6PWV5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Arid3cA6PWV5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Arid3cA6PWV5 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Arid3cA6PWV5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Arid3cA6PWV5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Arid3cA6PWV5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Arid3cA6PWV5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms