Protein–RNA interactions for Protein: A2AT37

Upf2, UPF2 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf2A2AT37 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Upf2A2AT37 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Upf2A2AT37 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Upf2A2AT37 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Upf2A2AT37 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Upf2A2AT37 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Upf2A2AT37 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Upf2A2AT37 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Upf2A2AT37 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Upf2A2AT37 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Upf2A2AT37 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Upf2A2AT37 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Upf2A2AT37 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Upf2A2AT37 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Upf2A2AT37 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Upf2A2AT37 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Upf2A2AT37 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Upf2A2AT37 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Upf2A2AT37 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Upf2A2AT37 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Upf2A2AT37 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Upf2A2AT37 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Upf2A2AT37 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Upf2A2AT37 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Upf2A2AT37 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Upf2A2AT37 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Upf2A2AT37 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Upf2A2AT37 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Upf2A2AT37 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Upf2A2AT37 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Upf2A2AT37 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Upf2A2AT37 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Upf2A2AT37 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Upf2A2AT37 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Upf2A2AT37 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Upf2A2AT37 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Upf2A2AT37 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Upf2A2AT37 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Upf2A2AT37 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Upf2A2AT37 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Upf2A2AT37 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Upf2A2AT37 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Upf2A2AT37 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Upf2A2AT37 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Upf2A2AT37 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Upf2A2AT37 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Upf2A2AT37 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Upf2A2AT37 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Upf2A2AT37 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Upf2A2AT37 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Upf2A2AT37 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Upf2A2AT37 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Upf2A2AT37 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Upf2A2AT37 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Upf2A2AT37 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Upf2A2AT37 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Upf2A2AT37 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Upf2A2AT37 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Upf2A2AT37 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Upf2A2AT37 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Upf2A2AT37 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Upf2A2AT37 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Upf2A2AT37 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Upf2A2AT37 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Upf2A2AT37 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Upf2A2AT37 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Upf2A2AT37 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Upf2A2AT37 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Upf2A2AT37 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Upf2A2AT37 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Upf2A2AT37 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Upf2A2AT37 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Upf2A2AT37 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Upf2A2AT37 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Upf2A2AT37 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Upf2A2AT37 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Upf2A2AT37 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Upf2A2AT37 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Upf2A2AT37 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Upf2A2AT37 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Upf2A2AT37 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Upf2A2AT37 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Upf2A2AT37 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Upf2A2AT37 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Upf2A2AT37 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Upf2A2AT37 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Upf2A2AT37 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Upf2A2AT37 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Upf2A2AT37 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Upf2A2AT37 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Upf2A2AT37 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Upf2A2AT37 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Upf2A2AT37 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Upf2A2AT37 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Upf2A2AT37 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Upf2A2AT37 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Upf2A2AT37 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Upf2A2AT37 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Upf2A2AT37 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Upf2A2AT37 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms