Protein–RNA interactions for Protein: A2ASJ1

Pramef17, PRAME family member 17, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef17A2ASJ1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pramef17A2ASJ1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pramef17A2ASJ1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pramef17A2ASJ1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Pramef17A2ASJ1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pramef17A2ASJ1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pramef17A2ASJ1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pramef17A2ASJ1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pramef17A2ASJ1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pramef17A2ASJ1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pramef17A2ASJ1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pramef17A2ASJ1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pramef17A2ASJ1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pramef17A2ASJ1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pramef17A2ASJ1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pramef17A2ASJ1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pramef17A2ASJ1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pramef17A2ASJ1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pramef17A2ASJ1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pramef17A2ASJ1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pramef17A2ASJ1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pramef17A2ASJ1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pramef17A2ASJ1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pramef17A2ASJ1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pramef17A2ASJ1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pramef17A2ASJ1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pramef17A2ASJ1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pramef17A2ASJ1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pramef17A2ASJ1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pramef17A2ASJ1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pramef17A2ASJ1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Pramef17A2ASJ1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pramef17A2ASJ1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pramef17A2ASJ1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pramef17A2ASJ1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pramef17A2ASJ1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pramef17A2ASJ1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pramef17A2ASJ1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pramef17A2ASJ1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pramef17A2ASJ1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pramef17A2ASJ1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pramef17A2ASJ1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pramef17A2ASJ1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pramef17A2ASJ1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pramef17A2ASJ1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pramef17A2ASJ1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Pramef17A2ASJ1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pramef17A2ASJ1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Pramef17A2ASJ1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Pramef17A2ASJ1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pramef17A2ASJ1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pramef17A2ASJ1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pramef17A2ASJ1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pramef17A2ASJ1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pramef17A2ASJ1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pramef17A2ASJ1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pramef17A2ASJ1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pramef17A2ASJ1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pramef17A2ASJ1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pramef17A2ASJ1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pramef17A2ASJ1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pramef17A2ASJ1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pramef17A2ASJ1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pramef17A2ASJ1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pramef17A2ASJ1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pramef17A2ASJ1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pramef17A2ASJ1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pramef17A2ASJ1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pramef17A2ASJ1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pramef17A2ASJ1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pramef17A2ASJ1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pramef17A2ASJ1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pramef17A2ASJ1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pramef17A2ASJ1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pramef17A2ASJ1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Pramef17A2ASJ1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pramef17A2ASJ1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pramef17A2ASJ1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Pramef17A2ASJ1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pramef17A2ASJ1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pramef17A2ASJ1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pramef17A2ASJ1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pramef17A2ASJ1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pramef17A2ASJ1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pramef17A2ASJ1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pramef17A2ASJ1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pramef17A2ASJ1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pramef17A2ASJ1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pramef17A2ASJ1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pramef17A2ASJ1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pramef17A2ASJ1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pramef17A2ASJ1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pramef17A2ASJ1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pramef17A2ASJ1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pramef17A2ASJ1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pramef17A2ASJ1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pramef17A2ASJ1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pramef17A2ASJ1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pramef17A2ASJ1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pramef17A2ASJ1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms