Protein–RNA interactions for Protein: A2ARA8

Itga8, Integrin alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,062 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga8A2ARA8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga8A2ARA8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms