Protein–RNA interactions for Protein: A2AMM0

Cavin4, Caveolae-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin4A2AMM0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cavin4A2AMM0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cavin4A2AMM0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cavin4A2AMM0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Cavin4A2AMM0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cavin4A2AMM0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Cavin4A2AMM0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cavin4A2AMM0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cavin4A2AMM0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cavin4A2AMM0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cavin4A2AMM0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cavin4A2AMM0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cavin4A2AMM0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Cavin4A2AMM0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cavin4A2AMM0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cavin4A2AMM0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cavin4A2AMM0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cavin4A2AMM0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cavin4A2AMM0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cavin4A2AMM0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cavin4A2AMM0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cavin4A2AMM0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cavin4A2AMM0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cavin4A2AMM0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cavin4A2AMM0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cavin4A2AMM0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Cavin4A2AMM0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Cavin4A2AMM0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Cavin4A2AMM0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Cavin4A2AMM0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cavin4A2AMM0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cavin4A2AMM0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cavin4A2AMM0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cavin4A2AMM0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Cavin4A2AMM0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cavin4A2AMM0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Cavin4A2AMM0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cavin4A2AMM0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cavin4A2AMM0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cavin4A2AMM0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cavin4A2AMM0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cavin4A2AMM0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cavin4A2AMM0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Cavin4A2AMM0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cavin4A2AMM0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cavin4A2AMM0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cavin4A2AMM0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cavin4A2AMM0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cavin4A2AMM0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cavin4A2AMM0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cavin4A2AMM0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cavin4A2AMM0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cavin4A2AMM0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cavin4A2AMM0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cavin4A2AMM0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cavin4A2AMM0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cavin4A2AMM0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cavin4A2AMM0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cavin4A2AMM0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cavin4A2AMM0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cavin4A2AMM0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cavin4A2AMM0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cavin4A2AMM0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cavin4A2AMM0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cavin4A2AMM0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Cavin4A2AMM0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cavin4A2AMM0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cavin4A2AMM0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cavin4A2AMM0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cavin4A2AMM0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cavin4A2AMM0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cavin4A2AMM0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cavin4A2AMM0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cavin4A2AMM0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cavin4A2AMM0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cavin4A2AMM0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cavin4A2AMM0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cavin4A2AMM0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cavin4A2AMM0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cavin4A2AMM0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cavin4A2AMM0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cavin4A2AMM0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cavin4A2AMM0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cavin4A2AMM0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cavin4A2AMM0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cavin4A2AMM0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cavin4A2AMM0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cavin4A2AMM0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Cavin4A2AMM0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cavin4A2AMM0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cavin4A2AMM0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cavin4A2AMM0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cavin4A2AMM0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cavin4A2AMM0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cavin4A2AMM0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cavin4A2AMM0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cavin4A2AMM0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cavin4A2AMM0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cavin4A2AMM0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cavin4A2AMM0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms