Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms