Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ambra1A2AH22 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ambra1A2AH22 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ambra1A2AH22 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ambra1A2AH22 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ambra1A2AH22 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ambra1A2AH22 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ambra1A2AH22 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ambra1A2AH22 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ambra1A2AH22 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ambra1A2AH22 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ambra1A2AH22 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ambra1A2AH22 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ambra1A2AH22 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ambra1A2AH22 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ambra1A2AH22 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ambra1A2AH22 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ambra1A2AH22 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ambra1A2AH22 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ambra1A2AH22 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ambra1A2AH22 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ambra1A2AH22 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ambra1A2AH22 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ambra1A2AH22 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ambra1A2AH22 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ambra1A2AH22 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ambra1A2AH22 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ambra1A2AH22 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ambra1A2AH22 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ambra1A2AH22 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ambra1A2AH22 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ambra1A2AH22 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ambra1A2AH22 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ambra1A2AH22 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ambra1A2AH22 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ambra1A2AH22 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ambra1A2AH22 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ambra1A2AH22 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ambra1A2AH22 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ambra1A2AH22 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ambra1A2AH22 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ambra1A2AH22 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ambra1A2AH22 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ambra1A2AH22 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ambra1A2AH22 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ambra1A2AH22 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ambra1A2AH22 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ambra1A2AH22 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ambra1A2AH22 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ambra1A2AH22 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ambra1A2AH22 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ambra1A2AH22 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ambra1A2AH22 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ambra1A2AH22 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ambra1A2AH22 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ambra1A2AH22 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ambra1A2AH22 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ambra1A2AH22 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ambra1A2AH22 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ambra1A2AH22 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ambra1A2AH22 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ambra1A2AH22 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ambra1A2AH22 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ambra1A2AH22 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ambra1A2AH22 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ambra1A2AH22 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ambra1A2AH22 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ambra1A2AH22 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ambra1A2AH22 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ambra1A2AH22 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ambra1A2AH22 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ambra1A2AH22 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ambra1A2AH22 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ambra1A2AH22 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ambra1A2AH22 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms