Protein–RNA interactions for Protein: A2AGX3

Prdm11, PR domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm11A2AGX3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Prdm11A2AGX3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Prdm11A2AGX3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prdm11A2AGX3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prdm11A2AGX3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Prdm11A2AGX3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prdm11A2AGX3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Prdm11A2AGX3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prdm11A2AGX3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prdm11A2AGX3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prdm11A2AGX3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prdm11A2AGX3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prdm11A2AGX3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prdm11A2AGX3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prdm11A2AGX3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prdm11A2AGX3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prdm11A2AGX3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prdm11A2AGX3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prdm11A2AGX3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prdm11A2AGX3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm11A2AGX3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm11A2AGX3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm11A2AGX3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm11A2AGX3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm11A2AGX3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm11A2AGX3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm11A2AGX3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm11A2AGX3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm11A2AGX3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm11A2AGX3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm11A2AGX3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm11A2AGX3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm11A2AGX3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Prdm11A2AGX3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prdm11A2AGX3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Prdm11A2AGX3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prdm11A2AGX3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prdm11A2AGX3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Prdm11A2AGX3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prdm11A2AGX3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prdm11A2AGX3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm11A2AGX3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm11A2AGX3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm11A2AGX3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm11A2AGX3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm11A2AGX3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm11A2AGX3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm11A2AGX3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm11A2AGX3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm11A2AGX3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm11A2AGX3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm11A2AGX3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm11A2AGX3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm11A2AGX3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm11A2AGX3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm11A2AGX3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm11A2AGX3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm11A2AGX3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm11A2AGX3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm11A2AGX3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm11A2AGX3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm11A2AGX3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm11A2AGX3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm11A2AGX3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm11A2AGX3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prdm11A2AGX3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prdm11A2AGX3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prdm11A2AGX3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Prdm11A2AGX3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prdm11A2AGX3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prdm11A2AGX3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prdm11A2AGX3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prdm11A2AGX3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prdm11A2AGX3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Prdm11A2AGX3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prdm11A2AGX3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prdm11A2AGX3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prdm11A2AGX3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prdm11A2AGX3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prdm11A2AGX3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prdm11A2AGX3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prdm11A2AGX3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prdm11A2AGX3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prdm11A2AGX3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prdm11A2AGX3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Prdm11A2AGX3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prdm11A2AGX3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prdm11A2AGX3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prdm11A2AGX3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prdm11A2AGX3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prdm11A2AGX3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prdm11A2AGX3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prdm11A2AGX3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prdm11A2AGX3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prdm11A2AGX3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prdm11A2AGX3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prdm11A2AGX3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prdm11A2AGX3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prdm11A2AGX3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prdm11A2AGX3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms