Protein–RNA interactions for Protein: A2AB62

1700023F06Rik, RIKEN cDNA 1700023F06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700023F06RikA2AB62 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700023F06RikA2AB62 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms