Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pramef6A2A8M8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pramef6A2A8M8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pramef6A2A8M8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pramef6A2A8M8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pramef6A2A8M8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pramef6A2A8M8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pramef6A2A8M8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Pramef6A2A8M8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pramef6A2A8M8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pramef6A2A8M8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pramef6A2A8M8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pramef6A2A8M8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pramef6A2A8M8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pramef6A2A8M8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pramef6A2A8M8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pramef6A2A8M8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pramef6A2A8M8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pramef6A2A8M8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pramef6A2A8M8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pramef6A2A8M8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pramef6A2A8M8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pramef6A2A8M8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pramef6A2A8M8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pramef6A2A8M8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pramef6A2A8M8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pramef6A2A8M8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pramef6A2A8M8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pramef6A2A8M8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Pramef6A2A8M8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pramef6A2A8M8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pramef6A2A8M8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pramef6A2A8M8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pramef6A2A8M8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Pramef6A2A8M8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Pramef6A2A8M8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Pramef6A2A8M8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Pramef6A2A8M8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Pramef6A2A8M8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pramef6A2A8M8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Pramef6A2A8M8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pramef6A2A8M8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pramef6A2A8M8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pramef6A2A8M8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pramef6A2A8M8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pramef6A2A8M8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pramef6A2A8M8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pramef6A2A8M8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pramef6A2A8M8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pramef6A2A8M8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pramef6A2A8M8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pramef6A2A8M8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
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Pramef6A2A8M8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pramef6A2A8M8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pramef6A2A8M8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pramef6A2A8M8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pramef6A2A8M8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pramef6A2A8M8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pramef6A2A8M8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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