Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LI67

Frmpd2, FERM and PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd2A0A140LI67 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Frmpd2A0A140LI67 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Frmpd2A0A140LI67 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Frmpd2A0A140LI67 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Frmpd2A0A140LI67 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Frmpd2A0A140LI67 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Frmpd2A0A140LI67 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Frmpd2A0A140LI67 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Frmpd2A0A140LI67 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Frmpd2A0A140LI67 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Frmpd2A0A140LI67 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Frmpd2A0A140LI67 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Frmpd2A0A140LI67 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Frmpd2A0A140LI67 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Frmpd2A0A140LI67 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Frmpd2A0A140LI67 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Frmpd2A0A140LI67 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Frmpd2A0A140LI67 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Frmpd2A0A140LI67 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Frmpd2A0A140LI67 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Frmpd2A0A140LI67 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Frmpd2A0A140LI67 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Frmpd2A0A140LI67 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Frmpd2A0A140LI67 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Frmpd2A0A140LI67 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Frmpd2A0A140LI67 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Frmpd2A0A140LI67 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Frmpd2A0A140LI67 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Frmpd2A0A140LI67 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Frmpd2A0A140LI67 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Frmpd2A0A140LI67 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Frmpd2A0A140LI67 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Frmpd2A0A140LI67 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Frmpd2A0A140LI67 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Frmpd2A0A140LI67 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Frmpd2A0A140LI67 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Frmpd2A0A140LI67 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Frmpd2A0A140LI67 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Frmpd2A0A140LI67 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Frmpd2A0A140LI67 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Frmpd2A0A140LI67 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Frmpd2A0A140LI67 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Frmpd2A0A140LI67 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Frmpd2A0A140LI67 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Frmpd2A0A140LI67 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Frmpd2A0A140LI67 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Frmpd2A0A140LI67 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Frmpd2A0A140LI67 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Frmpd2A0A140LI67 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Frmpd2A0A140LI67 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Frmpd2A0A140LI67 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Frmpd2A0A140LI67 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Frmpd2A0A140LI67 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Frmpd2A0A140LI67 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Frmpd2A0A140LI67 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Frmpd2A0A140LI67 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Frmpd2A0A140LI67 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Frmpd2A0A140LI67 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Frmpd2A0A140LI67 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Frmpd2A0A140LI67 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Frmpd2A0A140LI67 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Frmpd2A0A140LI67 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Frmpd2A0A140LI67 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Frmpd2A0A140LI67 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Frmpd2A0A140LI67 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Frmpd2A0A140LI67 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Frmpd2A0A140LI67 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Frmpd2A0A140LI67 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Frmpd2A0A140LI67 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Frmpd2A0A140LI67 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Frmpd2A0A140LI67 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Frmpd2A0A140LI67 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Frmpd2A0A140LI67 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Frmpd2A0A140LI67 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Frmpd2A0A140LI67 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Frmpd2A0A140LI67 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Frmpd2A0A140LI67 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Frmpd2A0A140LI67 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Frmpd2A0A140LI67 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Frmpd2A0A140LI67 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Frmpd2A0A140LI67 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Frmpd2A0A140LI67 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Frmpd2A0A140LI67 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Frmpd2A0A140LI67 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Frmpd2A0A140LI67 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Frmpd2A0A140LI67 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Frmpd2A0A140LI67 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Frmpd2A0A140LI67 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Frmpd2A0A140LI67 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Frmpd2A0A140LI67 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Frmpd2A0A140LI67 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Frmpd2A0A140LI67 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Frmpd2A0A140LI67 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Frmpd2A0A140LI67 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Frmpd2A0A140LI67 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Frmpd2A0A140LI67 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Frmpd2A0A140LI67 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Frmpd2A0A140LI67 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Frmpd2A0A140LI67 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Frmpd2A0A140LI67 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms