Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SVU1

Gm7298, Predicted gene 7298, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7298A0A0N4SVU1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Gm7298A0A0N4SVU1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Gm7298A0A0N4SVU1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Gm7298A0A0N4SVU1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Gm7298A0A0N4SVU1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Gm7298A0A0N4SVU1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Gm7298A0A0N4SVU1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Gm7298A0A0N4SVU1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Gm7298A0A0N4SVU1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gm7298A0A0N4SVU1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gm7298A0A0N4SVU1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gm7298A0A0N4SVU1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gm7298A0A0N4SVU1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gm7298A0A0N4SVU1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gm7298A0A0N4SVU1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gm7298A0A0N4SVU1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gm7298A0A0N4SVU1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gm7298A0A0N4SVU1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gm7298A0A0N4SVU1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gm7298A0A0N4SVU1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Gm7298A0A0N4SVU1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gm7298A0A0N4SVU1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gm7298A0A0N4SVU1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gm7298A0A0N4SVU1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gm7298A0A0N4SVU1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gm7298A0A0N4SVU1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gm7298A0A0N4SVU1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gm7298A0A0N4SVU1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gm7298A0A0N4SVU1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gm7298A0A0N4SVU1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gm7298A0A0N4SVU1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gm7298A0A0N4SVU1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gm7298A0A0N4SVU1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Gm7298A0A0N4SVU1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gm7298A0A0N4SVU1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gm7298A0A0N4SVU1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Gm7298A0A0N4SVU1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Gm7298A0A0N4SVU1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Gm7298A0A0N4SVU1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Gm7298A0A0N4SVU1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Gm7298A0A0N4SVU1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Gm7298A0A0N4SVU1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gm7298A0A0N4SVU1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gm7298A0A0N4SVU1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gm7298A0A0N4SVU1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gm7298A0A0N4SVU1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gm7298A0A0N4SVU1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gm7298A0A0N4SVU1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gm7298A0A0N4SVU1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gm7298A0A0N4SVU1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gm7298A0A0N4SVU1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gm7298A0A0N4SVU1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gm7298A0A0N4SVU1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gm7298A0A0N4SVU1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gm7298A0A0N4SVU1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gm7298A0A0N4SVU1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gm7298A0A0N4SVU1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gm7298A0A0N4SVU1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gm7298A0A0N4SVU1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gm7298A0A0N4SVU1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gm7298A0A0N4SVU1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gm7298A0A0N4SVU1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gm7298A0A0N4SVU1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Gm7298A0A0N4SVU1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gm7298A0A0N4SVU1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gm7298A0A0N4SVU1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gm7298A0A0N4SVU1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gm7298A0A0N4SVU1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gm7298A0A0N4SVU1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gm7298A0A0N4SVU1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gm7298A0A0N4SVU1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gm7298A0A0N4SVU1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gm7298A0A0N4SVU1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Gm7298A0A0N4SVU1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gm7298A0A0N4SVU1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gm7298A0A0N4SVU1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gm7298A0A0N4SVU1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gm7298A0A0N4SVU1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gm7298A0A0N4SVU1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gm7298A0A0N4SVU1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gm7298A0A0N4SVU1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gm7298A0A0N4SVU1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gm7298A0A0N4SVU1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gm7298A0A0N4SVU1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Gm7298A0A0N4SVU1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Gm7298A0A0N4SVU1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Gm7298A0A0N4SVU1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Gm7298A0A0N4SVU1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Gm7298A0A0N4SVU1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Gm7298A0A0N4SVU1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Gm7298A0A0N4SVU1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Gm7298A0A0N4SVU1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Gm7298A0A0N4SVU1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gm7298A0A0N4SVU1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gm7298A0A0N4SVU1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gm7298A0A0N4SVU1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gm7298A0A0N4SVU1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gm7298A0A0N4SVU1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gm7298A0A0N4SVU1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gm7298A0A0N4SVU1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms