Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YYE3

Trbv15, T cell receptor beta, variable 15 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv15A0A0A6YYE3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Trbv15A0A0A6YYE3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Trbv15A0A0A6YYE3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Trbv15A0A0A6YYE3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Trbv15A0A0A6YYE3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trbv15A0A0A6YYE3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trbv15A0A0A6YYE3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trbv15A0A0A6YYE3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trbv15A0A0A6YYE3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trbv15A0A0A6YYE3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Trbv15A0A0A6YYE3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Trbv15A0A0A6YYE3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trbv15A0A0A6YYE3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Trbv15A0A0A6YYE3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trbv15A0A0A6YYE3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trbv15A0A0A6YYE3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Trbv15A0A0A6YYE3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv15A0A0A6YYE3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Trbv15A0A0A6YYE3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Trbv15A0A0A6YYE3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv15A0A0A6YYE3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Trbv15A0A0A6YYE3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Trbv15A0A0A6YYE3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv15A0A0A6YYE3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Trbv15A0A0A6YYE3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv15A0A0A6YYE3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv15A0A0A6YYE3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Trbv15A0A0A6YYE3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv15A0A0A6YYE3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv15A0A0A6YYE3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv15A0A0A6YYE3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv15A0A0A6YYE3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv15A0A0A6YYE3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv15A0A0A6YYE3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv15A0A0A6YYE3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv15A0A0A6YYE3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv15A0A0A6YYE3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv15A0A0A6YYE3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv15A0A0A6YYE3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv15A0A0A6YYE3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv15A0A0A6YYE3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv15A0A0A6YYE3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv15A0A0A6YYE3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv15A0A0A6YYE3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv15A0A0A6YYE3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv15A0A0A6YYE3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv15A0A0A6YYE3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv15A0A0A6YYE3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv15A0A0A6YYE3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv15A0A0A6YYE3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv15A0A0A6YYE3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Trbv15A0A0A6YYE3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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