Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Gm18503-201ENSMUST00000220340 728 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Crlf3Q9Z2L7 Gm5791-201ENSMUST00000220840 489 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Crlf3Q9Z2L7 CT009718.2-202ENSMUST00000222092 704 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Crlf3Q9Z2L7 AC130219.2-201ENSMUST00000228765 807 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Crlf3Q9Z2L7 AC154838.3-201ENSMUST00000228876 965 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Crlf3Q9Z2L7 Ly6c1-201ENSMUST00000065408 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Crlf3Q9Z2L7 Vmn1r37-201ENSMUST00000077482 909 ntAPPRIS P2 BASIC7□□□□□ -1.29
Crlf3Q9Z2L7 Trpm8-204ENSMUST00000171176 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Crlf3Q9Z2L7 Gm46348-201ENSMUST00000222917 2151 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Crlf3Q9Z2L7 Sh2d1b2-202ENSMUST00000162752 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Crlf3Q9Z2L7 Ceacam1-208ENSMUST00000206676 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Crlf3Q9Z2L7 A630072L19Rik-202ENSMUST00000221309 1519 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Crlf3Q9Z2L7 Gm5600-202ENSMUST00000211589 2331 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Crlf3Q9Z2L7 A130050O07Rik-201ENSMUST00000191963 3023 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Crlf3Q9Z2L7 Tpx2-207ENSMUST00000178997 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Crlf3Q9Z2L7 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Crlf3Q9Z2L7 Lilrb4a-201ENSMUST00000217706 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Crlf3Q9Z2L7 Olfr348-202ENSMUST00000213498 3540 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Crlf3Q9Z2L7 Sv2b-204ENSMUST00000206344 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Crlf3Q9Z2L7 Olfr671-203ENSMUST00000217091 3225 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Crlf3Q9Z2L7 Zfand4-201ENSMUST00000036503 3123 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Crlf3Q9Z2L7 Satb1-214ENSMUST00000176669 4407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Crlf3Q9Z2L7 Synb-201ENSMUST00000059362 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Crlf3Q9Z2L7 Asb4-201ENSMUST00000043294 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Crlf3Q9Z2L7 Sin3a-201ENSMUST00000049169 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Crlf3Q9Z2L7 Olfr1294-202ENSMUST00000208675 1983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Crlf3Q9Z2L7 Rab3b-202ENSMUST00000106650 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Crlf3Q9Z2L7 1700092K14Rik-201ENSMUST00000106604 395 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Crlf3Q9Z2L7 Cypt3-202ENSMUST00000112573 669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Crlf3Q9Z2L7 Gm14480-201ENSMUST00000118521 433 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Crlf3Q9Z2L7 Gm5319-201ENSMUST00000118965 873 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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Crlf3Q9Z2L7 Gm12484-201ENSMUST00000156311 581 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Crlf3Q9Z2L7 Gm26801-201ENSMUST00000180591 1219 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Crlf3Q9Z2L7 1700040L08Rik-201ENSMUST00000205011 541 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Crlf3Q9Z2L7 AC132590.1-201ENSMUST00000224374 1164 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Crlf3Q9Z2L7 5031410I06Rik-201ENSMUST00000063524 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Crlf3Q9Z2L7 Gm7347-201ENSMUST00000095004 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Crlf3Q9Z2L7 Trove2-202ENSMUST00000159879 8738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Crlf3Q9Z2L7 4921539E11Rik-201ENSMUST00000030245 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Crlf3Q9Z2L7 Grik2-207ENSMUST00000218823 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Crlf3Q9Z2L7 Nyap2-204ENSMUST00000123720 3471 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Crlf3Q9Z2L7 Hapln1-201ENSMUST00000022108 5715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Crlf3Q9Z2L7 Pus3-202ENSMUST00000121246 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Crlf3Q9Z2L7 C330024D21Rik-202ENSMUST00000202634 2020 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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Crlf3Q9Z2L7 Gm15054-201ENSMUST00000117393 281 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Crlf3Q9Z2L7 Gm15217-202ENSMUST00000141358 347 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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Crlf3Q9Z2L7 1700001G01Rik-204ENSMUST00000153022 928 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Crlf3Q9Z2L7 Gm22915-201ENSMUST00000157615 136 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Crlf3Q9Z2L7 Smarca2-210ENSMUST00000176475 983 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Crlf3Q9Z2L7 Gm4308-201ENSMUST00000179735 914 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Crlf3Q9Z2L7 Gm4301-201ENSMUST00000186197 914 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Crlf3Q9Z2L7 Gm4312-201ENSMUST00000190264 914 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Crlf3Q9Z2L7 Gm43387-201ENSMUST00000196896 1066 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Crlf3Q9Z2L7 Gm4605-201ENSMUST00000203148 625 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Crlf3Q9Z2L7 Rpl19-ps9-201ENSMUST00000205423 588 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Crlf3Q9Z2L7 Gm45394-201ENSMUST00000209240 1175 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Crlf3Q9Z2L7 Gm31045-201ENSMUST00000211266 922 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Crlf3Q9Z2L7 Gm32899-201ENSMUST00000219694 207 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Crlf3Q9Z2L7 Gm46231-201ENSMUST00000220152 314 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Crlf3Q9Z2L7 AC161877.2-201ENSMUST00000226248 545 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Crlf3Q9Z2L7 AC139209.2-201ENSMUST00000227680 1208 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Crlf3Q9Z2L7 Uqcrh-201ENSMUST00000050580 402 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Crlf3Q9Z2L7 Olfr429-201ENSMUST00000060693 943 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Crlf3Q9Z2L7 Uqcrh-202ENSMUST00000078676 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Crlf3Q9Z2L7 Il22-201ENSMUST00000096691 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Crlf3Q9Z2L7 Gm33167-201ENSMUST00000201933 2643 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Crlf3Q9Z2L7 Stag2-203ENSMUST00000115073 6171 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Crlf3Q9Z2L7 Vmn2r11-201ENSMUST00000164875 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Crlf3Q9Z2L7 5330413P13Rik-203ENSMUST00000150466 2173 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Crlf3Q9Z2L7 Gm28311-201ENSMUST00000185236 1497 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Crlf3Q9Z2L7 Gm28549-202ENSMUST00000191354 1497 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Crlf3Q9Z2L7 Gm29617-206ENSMUST00000187759 1600 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89 ms