Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Kcnj6-203ENSMUST00000165538 3637 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Olfr1426-205ENSMUST00000219155 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r50-202ENSMUST00000089417 2059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 AC116950.1-201ENSMUST00000226322 3250 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Olfr1033-203ENSMUST00000214546 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 A830082K12Rik-207ENSMUST00000183171 4176 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm4073-201ENSMUST00000176792 3500 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Ighv1-84-201ENSMUST00000103551 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm11318-201ENSMUST00000118640 961 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm11850-201ENSMUST00000119679 479 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Dnase1-202ENSMUST00000120009 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm7571-201ENSMUST00000120252 927 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm25320-201ENSMUST00000122551 324 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Lypd8-201ENSMUST00000013787 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm22000-201ENSMUST00000153087 730 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm24130-201ENSMUST00000158536 151 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Scgb1b28-ps-201ENSMUST00000163647 290 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Svs5-201ENSMUST00000017148 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Apol11a-201ENSMUST00000172191 1132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 B230104I21Rik-201ENSMUST00000181143 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Mir6337-201ENSMUST00000184194 105 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Ly6c2-204ENSMUST00000191451 538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Slamf6-204ENSMUST00000194561 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm17660-203ENSMUST00000198485 522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 9230114K14Rik-204ENSMUST00000199805 695 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm45446-201ENSMUST00000209348 216 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm45732-201ENSMUST00000212460 586 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 AL713985.1-201ENSMUST00000219030 420 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Tcl1b2-201ENSMUST00000081379 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Rbms3-205ENSMUST00000111772 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 6430584L05Rik-201ENSMUST00000204412 3151 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Olfr348-204ENSMUST00000215199 3557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm44141-201ENSMUST00000204231 1583 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Grik2-202ENSMUST00000105484 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Srrm1-201ENSMUST00000030613 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Hrasls-201ENSMUST00000089824 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Itih2-201ENSMUST00000042290 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Triml1-201ENSMUST00000059692 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Oxr1-207ENSMUST00000179393 4498 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Nmd3-201ENSMUST00000029358 9135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 3732407C23Rik-201ENSMUST00000222770 3540 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Slc17a4-202ENSMUST00000110407 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Clec2g-201ENSMUST00000000254 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r198-204ENSMUST00000227167 5990 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Ttc21b-202ENSMUST00000125446 4061 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Tek-203ENSMUST00000102798 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gatad2b-203ENSMUST00000197988 1815 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Nsd2-205ENSMUST00000114399 7786 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm42772-201ENSMUST00000199945 3041 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Zfp462-203ENSMUST00000098070 10465 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Mettl6-201ENSMUST00000055303 3946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Cfap61-206ENSMUST00000133433 3998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Pramef8-201ENSMUST00000037356 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Alkbh8-202ENSMUST00000165105 2256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Ugt2b38-201ENSMUST00000072818 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Dennd1b-201ENSMUST00000094505 8073 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Golga1-202ENSMUST00000112850 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Cav1-205ENSMUST00000115456 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm11969-201ENSMUST00000118848 356 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm12123-201ENSMUST00000120348 472 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Cox7c-204ENSMUST00000132233 709 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm15857-201ENSMUST00000133476 789 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 4931413K12Rik-201ENSMUST00000142068 1282 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm10660-201ENSMUST00000148610 1203 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm15351-203ENSMUST00000153095 406 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm23891-201ENSMUST00000158114 138 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm17051-201ENSMUST00000170787 487 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Mir3471-2-201ENSMUST00000174896 102 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 4833412C05Rik-201ENSMUST00000181235 1083 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 4930467D21Rik-202ENSMUST00000181724 570 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Krtdap-203ENSMUST00000187493 420 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Krtdap-205ENSMUST00000189673 345 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Krtdap-206ENSMUST00000189962 323 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Krtdap-209ENSMUST00000190990 403 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm38203-201ENSMUST00000191815 245 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm31881-202ENSMUST00000199455 559 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm40319-201ENSMUST00000199785 481 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm7478-201ENSMUST00000201054 581 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm4872-201ENSMUST00000205210 1299 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm9689-201ENSMUST00000210009 428 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm45627-201ENSMUST00000210130 977 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm4780-201ENSMUST00000213206 1242 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm6885-201ENSMUST00000217261 372 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Elovl2-201ENSMUST00000021793 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 AC165349.2-201ENSMUST00000219097 426 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 AC079680.1-202ENSMUST00000219835 654 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 AC130673.1-201ENSMUST00000227992 435 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Olfr1113-201ENSMUST00000079966 981 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Krtdap-201ENSMUST00000098559 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm5886-203ENSMUST00000203983 2613 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Abca6-201ENSMUST00000044003 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gm5087-201ENSMUST00000060526 1921 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Stat4-201ENSMUST00000027277 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Dennd2c-202ENSMUST00000172288 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Csde1-206ENSMUST00000197488 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Olfr958-203ENSMUST00000217227 3831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 Gtpbp4-204ENSMUST00000222098 8783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rnf4Q9QZS2 1700007E05Rik-201ENSMUST00000186196 1513 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.2 ms