Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Itih4-202ENSMUST00000078490 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm6811-201ENSMUST00000169389 1533 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm18879-201ENSMUST00000221187 1537 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Mcf2l-205ENSMUST00000110871 3401 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Slc25a40-202ENSMUST00000170496 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm2065-201ENSMUST00000194697 2757 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm20560-201ENSMUST00000204577 3513 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Tbc1d24-203ENSMUST00000097376 7265 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Fndc1-202ENSMUST00000097425 5845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm28993-201ENSMUST00000186236 1499 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm37870-201ENSMUST00000192349 1499 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm37467-202ENSMUST00000192785 1499 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm37252-201ENSMUST00000195063 1499 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm38013-202ENSMUST00000195453 1499 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm37286-201ENSMUST00000195885 1499 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm12794-201ENSMUST00000052027 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Kmt2a-201ENSMUST00000002095 16461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Fasl-201ENSMUST00000000834 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Osbpl9-216ENSMUST00000161363 2356 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Mmp20-201ENSMUST00000034487 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Igkv4-79-201ENSMUST00000103342 358 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 C87499-202ENSMUST00000107142 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm21103-201ENSMUST00000112737 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm16346-201ENSMUST00000129158 937 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 AI847159-203ENSMUST00000141786 915 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm3047-201ENSMUST00000164069 822 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm3029-201ENSMUST00000168306 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm22548-201ENSMUST00000174899 78 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm27853-201ENSMUST00000184176 250 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Aspa-206ENSMUST00000184572 1746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Fabp9-202ENSMUST00000191678 647 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm38097-201ENSMUST00000192936 439 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm5154-201ENSMUST00000203971 399 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Olfr1449-202ENSMUST00000208624 1296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm18914-201ENSMUST00000214625 616 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm4803-201ENSMUST00000218729 1279 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 AC154861.1-201ENSMUST00000223767 800 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 CT009515.3-201ENSMUST00000226509 671 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Foxn3-201ENSMUST00000046859 7705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Olfr691-201ENSMUST00000057528 969 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm8526-201ENSMUST00000079153 475 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Zfp850-201ENSMUST00000099111 941 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 St3gal1-201ENSMUST00000092640 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm43336-201ENSMUST00000200487 4504 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Pus7-204ENSMUST00000131992 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 AC130219.1-201ENSMUST00000228406 3433 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm12532-201ENSMUST00000148448 2684 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm14471-201ENSMUST00000141035 2358 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Fyco1-201ENSMUST00000084715 7949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm8279-202ENSMUST00000165713 1760 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm5795-203ENSMUST00000171150 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Atp1a4-201ENSMUST00000111243 3470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 D830026I12Rik-203ENSMUST00000151170 1607 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm37139-201ENSMUST00000192134 4419 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Macrod2os2-201ENSMUST00000143227 3566 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Platr8-201ENSMUST00000146110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Psg20-202ENSMUST00000108482 1871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Olfr1275-202ENSMUST00000216421 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm5113-201ENSMUST00000085668 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Rims2-201ENSMUST00000042917 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Arpp21-202ENSMUST00000070218 3181 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Msn-201ENSMUST00000117399 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 A730091E23Rik-201ENSMUST00000221700 3825 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Ighv1-16-201ENSMUST00000103501 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Ighv1-24-201ENSMUST00000103509 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm24473-201ENSMUST00000104483 131 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm14529-201ENSMUST00000117894 406 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Rapgef4os1-201ENSMUST00000126462 638 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 1700091H14Rik-201ENSMUST00000167772 590 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps37-201ENSMUST00000174682 1044 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm28985-201ENSMUST00000189261 356 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 AC166352.1-201ENSMUST00000215483 1105 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Fkbp1a-ps2-201ENSMUST00000219474 311 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm46332-202ENSMUST00000220320 516 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Sprr2b-201ENSMUST00000061038 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Sprr2k-201ENSMUST00000067102 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Zfp626-201ENSMUST00000080175 816 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm24695-201ENSMUST00000083877 83 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm156-201ENSMUST00000095409 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm10825-201ENSMUST00000180537 4478 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm26581-201ENSMUST00000181953 4479 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Arhgap32-206ENSMUST00000182802 5621 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Rbm27-202ENSMUST00000091920 6266 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Myo7a-202ENSMUST00000107122 6867 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gpr182-201ENSMUST00000079692 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Afap1l2-201ENSMUST00000111584 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Pcyt1a-203ENSMUST00000115137 4244 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm19410-201ENSMUST00000207505 6352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Klhl1-201ENSMUST00000022666 6645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Kif1b-203ENSMUST00000060537 10233 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm6117-201ENSMUST00000150540 1333 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm37138-201ENSMUST00000194564 2089 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r16-201ENSMUST00000165180 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Plagl2-202ENSMUST00000109795 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Dysf-204ENSMUST00000113821 6803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Nup93-207ENSMUST00000212824 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
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