Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

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Length 287 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Gm29363-201ENSMUST00000189365 621 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm29382-201ENSMUST00000189549 615 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm29377-205ENSMUST00000189603 615 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm28327-201ENSMUST00000189638 615 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm28790-201ENSMUST00000189642 615 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm28907-201ENSMUST00000189700 615 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm29586-207ENSMUST00000189745 615 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm29115-201ENSMUST00000189870 615 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm28366-201ENSMUST00000190147 615 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm29212-201ENSMUST00000190384 615 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm29533-201ENSMUST00000190403 615 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 1700123O21Rik-201ENSMUST00000190515 677 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm28162-201ENSMUST00000190545 615 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm29030-201ENSMUST00000190848 615 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm28742-201ENSMUST00000191001 615 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm28899-201ENSMUST00000191161 615 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm29567-201ENSMUST00000191188 615 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm28222-201ENSMUST00000191210 615 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm28776-201ENSMUST00000191282 615 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm29306-201ENSMUST00000191366 615 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm29618-201ENSMUST00000191423 615 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm28136-210ENSMUST00000191432 615 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm29251-201ENSMUST00000191480 615 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm28658-201ENSMUST00000191532 615 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm32180-201ENSMUST00000192415 615 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm30598-201ENSMUST00000192620 615 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm37627-201ENSMUST00000194585 615 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm34274-201ENSMUST00000195825 615 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm8182-201ENSMUST00000197863 769 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm44111-201ENSMUST00000204649 399 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm44712-201ENSMUST00000206250 1076 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm44983-201ENSMUST00000208121 463 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm29154-205ENSMUST00000213325 1112 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm30676-202ENSMUST00000214464 793 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm2398-201ENSMUST00000218347 883 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 AC155834.1-201ENSMUST00000220033 498 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm7986-201ENSMUST00000221336 551 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Ly6g-201ENSMUST00000023246 336 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Dusp21-201ENSMUST00000026018 845 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Lipk-201ENSMUST00000054260 2125 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Olfr49-201ENSMUST00000059996 1030 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Olfr195-201ENSMUST00000075381 995 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Zfp626-201ENSMUST00000080175 816 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Sry-201ENSMUST00000091178 1188 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Efcab7-201ENSMUST00000097959 1713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Slc15a2-208ENSMUST00000165531 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm37937-201ENSMUST00000194130 2168 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 AC162301.1-201ENSMUST00000228785 1542 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Chrnb3-201ENSMUST00000060943 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Crtam-202ENSMUST00000180384 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm6327-201ENSMUST00000171185 1335 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Kcne3-203ENSMUST00000178946 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 CT030185.2-201ENSMUST00000222614 1310 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Myot-201ENSMUST00000025349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Cmah-207ENSMUST00000224657 3124 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Rab8b-201ENSMUST00000041139 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Crb1-204ENSMUST00000198445 6135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Tmem182-201ENSMUST00000114765 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Mdc1-201ENSMUST00000082337 7335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Stxbp4-202ENSMUST00000107872 2529 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Mkl2-204ENSMUST00000149359 8295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 9230020A06Rik-201ENSMUST00000151841 2051 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Cyp2c66-201ENSMUST00000087234 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Olfr66-202ENSMUST00000216303 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm8232-201ENSMUST00000164277 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Olfr678-202ENSMUST00000213622 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Mlh3-201ENSMUST00000019378 5463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Ppfia2-203ENSMUST00000217854 8885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Dclk1-208ENSMUST00000198437 4315 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Trpm8-202ENSMUST00000113114 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Calcrl-201ENSMUST00000074262 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Hsd3b2-202ENSMUST00000107022 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Stat4-201ENSMUST00000027277 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Tlr11-201ENSMUST00000063570 2993 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Ide-201ENSMUST00000131070 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm43099-201ENSMUST00000198943 5241 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Usp14-202ENSMUST00000116669 2019 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm25724-201ENSMUST00000104531 117 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm14864-201ENSMUST00000116164 1087 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Clec4n-203ENSMUST00000117130 1136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm15129-201ENSMUST00000119673 279 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm12860-201ENSMUST00000148457 957 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm27207-201ENSMUST00000184995 878 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm29099-201ENSMUST00000187370 760 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 4930590H14Rik-201ENSMUST00000193999 551 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Pilrb2-202ENSMUST00000196162 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm38102-202ENSMUST00000196428 174 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm9357-201ENSMUST00000207138 805 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm36231-201ENSMUST00000211183 217 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm30132-202ENSMUST00000212825 819 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm31013-201ENSMUST00000213576 715 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 AC154834.1-201ENSMUST00000224697 358 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Cst8-201ENSMUST00000028931 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Olfr535-201ENSMUST00000074897 991 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Vmn1r78-201ENSMUST00000078039 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm5446-201ENSMUST00000091762 784 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Cep97-201ENSMUST00000023270 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm9268-202ENSMUST00000173815 2565 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Piwil2-201ENSMUST00000048129 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Tll2-201ENSMUST00000025986 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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