Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim39Q9ESN2 Gpnmb-201ENSMUST00000031840 3701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 Gm12295-201ENSMUST00000128453 3189 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 Gm25607-201ENSMUST00000104020 127 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
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Trim39Q9ESN2 Mup6-203ENSMUST00000107521 642 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 Olfr1144-ps1-201ENSMUST00000118227 328 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 Mup-ps16-201ENSMUST00000120085 596 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 Gm13751-201ENSMUST00000120280 752 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 Gm12639-201ENSMUST00000121400 493 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
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