Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Gm26440-201ENSMUST00000082591 129 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Sult1b1-201ENSMUST00000031199 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Cmah-201ENSMUST00000050859 2444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Lsm6-203ENSMUST00000130325 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Ttc23-203ENSMUST00000107471 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Il6st-210ENSMUST00000184949 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Sh3glb1-204ENSMUST00000199531 2584 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Ccdc40-202ENSMUST00000053440 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Speer5-ps1-201ENSMUST00000169525 1430 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm43948-201ENSMUST00000203474 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm1559-201ENSMUST00000219596 3117 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Ptk2b-201ENSMUST00000022622 4034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm15232-201ENSMUST00000146929 2318 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Casp14-201ENSMUST00000005488 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Ehmt1-204ENSMUST00000114418 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Cage1-203ENSMUST00000110233 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Inpp5k-201ENSMUST00000006286 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Cacna1c-213ENSMUST00000188078 6519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Cacna1c-217ENSMUST00000188865 6519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Deup1-203ENSMUST00000115593 3019 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Unc45b-205ENSMUST00000164945 3555 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Pde4b-201ENSMUST00000030251 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gulo-201ENSMUST00000059970 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Csf3r-201ENSMUST00000030673 3160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Map4k4-217ENSMUST00000195636 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm21276-201ENSMUST00000179666 2626 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Zfp948-201ENSMUST00000088787 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Bag6-211ENSMUST00000173550 3536 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm26953-209ENSMUST00000213051 2087 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm10857-201ENSMUST00000195343 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Pln-206ENSMUST00000220197 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm44708-201ENSMUST00000205580 2237 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Adgrl2-217ENSMUST00000200154 5412 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Sntg1-204ENSMUST00000132064 4165 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Il1rap-201ENSMUST00000023156 4520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Mrpl24-202ENSMUST00000119968 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Arhgap32-206ENSMUST00000182802 5621 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 4930404I05Rik-201ENSMUST00000125902 2675 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Smok3a-202ENSMUST00000171498 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Rnf141-204ENSMUST00000175981 2333 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 4732419C18Rik-201ENSMUST00000181805 3536 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm20735-201ENSMUST00000212077 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Dmbx1-202ENSMUST00000084338 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Bfar-202ENSMUST00000069281 2456 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm22834-201ENSMUST00000102021 79 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm24981-201ENSMUST00000104459 132 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Mptx2-201ENSMUST00000111224 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm14853-201ENSMUST00000116081 549 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Ftx-201ENSMUST00000123841 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm11209-201ENSMUST00000130206 431 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 4930538E20Rik-201ENSMUST00000131383 546 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm14093-201ENSMUST00000145579 364 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm13411-201ENSMUST00000149429 414 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm23350-201ENSMUST00000158429 103 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm8220-202ENSMUST00000169601 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm23793-201ENSMUST00000179396 117 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm27676-201ENSMUST00000183669 61 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 1810018F18Rik-201ENSMUST00000188253 277 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Ndufc1-204ENSMUST00000193279 315 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm18551-201ENSMUST00000195594 642 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm30055-201ENSMUST00000203175 803 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm8423-201ENSMUST00000211387 607 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm19121-201ENSMUST00000215720 1022 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm40689-201ENSMUST00000218006 362 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 AC132384.2-201ENSMUST00000218018 526 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm9280-201ENSMUST00000223155 517 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 AC154583.1-201ENSMUST00000224788 655 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 AC154592.1-201ENSMUST00000225784 574 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 AC133203.1-201ENSMUST00000228241 301 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 AC170600.1-201ENSMUST00000228763 277 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Pebp1-201ENSMUST00000036951 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Commd3-201ENSMUST00000061158 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Sprr4-201ENSMUST00000062129 231 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Olfr1390-201ENSMUST00000062719 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Olfr1219-202ENSMUST00000213724 5669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Katnal1-201ENSMUST00000047257 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Kmt2a-201ENSMUST00000002095 16461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Cers3-201ENSMUST00000066475 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Cldn12-207ENSMUST00000179804 3752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Babam2-201ENSMUST00000063813 1410 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Htr3b-201ENSMUST00000008734 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 AC154597.1-201ENSMUST00000224095 2713 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Mmp10-201ENSMUST00000034488 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Ep400-210ENSMUST00000146458 3673 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Zfp873-201ENSMUST00000105313 1893 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm29077-201ENSMUST00000185784 2169 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm28696-201ENSMUST00000189187 2169 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm28206-201ENSMUST00000190437 2169 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm37657-201ENSMUST00000195425 2169 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm11733-201ENSMUST00000092394 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Zfp939-202ENSMUST00000186855 2480 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Ube2k-207ENSMUST00000202082 4506 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Plekha8-201ENSMUST00000101385 1838 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Olfr1480-204ENSMUST00000207987 1804 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm43776-201ENSMUST00000199729 2914 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Unc13d-202ENSMUST00000106450 4046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Dusp27-201ENSMUST00000085992 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Eif3c-201ENSMUST00000032992 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Deup1-201ENSMUST00000045513 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms