Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Gm15283-201ENSMUST00000125308 1451 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pfdn1Q9CWM4 Zfy2-202ENSMUST00000187148 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pfdn1Q9CWM4 Olfr537-ps1-202ENSMUST00000210949 2821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pfdn1Q9CWM4 Slc24a2-202ENSMUST00000107155 2171 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pfdn1Q9CWM4 AC164297.2-201ENSMUST00000224388 1508 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pfdn1Q9CWM4 Mrc1-201ENSMUST00000028045 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pfdn1Q9CWM4 4933409F18Rik-202ENSMUST00000222026 1584 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pfdn1Q9CWM4 Znhit3-201ENSMUST00000103195 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pfdn1Q9CWM4 Igkv9-123-201ENSMUST00000103313 377 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pfdn1Q9CWM4 Gm25607-201ENSMUST00000104020 127 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pfdn1Q9CWM4 Gm14676-201ENSMUST00000117722 858 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pfdn1Q9CWM4 Gm13545-201ENSMUST00000119044 482 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pfdn1Q9CWM4 Gm4918-201ENSMUST00000119420 1084 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pfdn1Q9CWM4 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pfdn1Q9CWM4 Gm5883-201ENSMUST00000120735 495 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pfdn1Q9CWM4 4930415H17Rik-201ENSMUST00000122396 123 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pfdn1Q9CWM4 BC021767-202ENSMUST00000136988 905 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pfdn1Q9CWM4 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pfdn1Q9CWM4 Gm8624-202ENSMUST00000165677 669 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pfdn1Q9CWM4 4930426I24Rik-201ENSMUST00000180709 601 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pfdn1Q9CWM4 Gm8167-201ENSMUST00000183320 958 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pfdn1Q9CWM4 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pfdn1Q9CWM4 Gm17847-201ENSMUST00000188261 1127 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pfdn1Q9CWM4 Fcer1g-203ENSMUST00000193973 683 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pfdn1Q9CWM4 Gm7442-201ENSMUST00000197778 383 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pfdn1Q9CWM4 Gm44096-201ENSMUST00000203171 504 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pfdn1Q9CWM4 Gm44253-201ENSMUST00000203387 628 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pfdn1Q9CWM4 Gm26911-202ENSMUST00000204244 763 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pfdn1Q9CWM4 AC154382.1-201ENSMUST00000220958 1282 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pfdn1Q9CWM4 CT030705.2-201ENSMUST00000225301 556 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pfdn1Q9CWM4 Cthrc1-204ENSMUST00000226433 596 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pfdn1Q9CWM4 Scp2d1-201ENSMUST00000028918 760 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pfdn1Q9CWM4 Glipr1-201ENSMUST00000074805 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pfdn1Q9CWM4 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pfdn1Q9CWM4 Gm5175-201ENSMUST00000218458 1703 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Pfdn1Q9CWM4 Pde1c-208ENSMUST00000170774 2132 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Pfdn1Q9CWM4 Rsph4a-201ENSMUST00000169670 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Pfdn1Q9CWM4 1700095J07Rik-201ENSMUST00000128017 1405 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Pfdn1Q9CWM4 Rnf146-205ENSMUST00000162335 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Pfdn1Q9CWM4 Lipf-201ENSMUST00000025680 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Pfdn1Q9CWM4 Slfn10-ps-202ENSMUST00000152760 2673 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Pfdn1Q9CWM4 Fam205a3-201ENSMUST00000178192 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Pfdn1Q9CWM4 Fam205a2-202ENSMUST00000180201 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Pfdn1Q9CWM4 Gm10415-201ENSMUST00000204181 2825 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pfdn1Q9CWM4 4930471M09Rik-202ENSMUST00000206475 1990 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pfdn1Q9CWM4 9430062P05Rik-201ENSMUST00000192703 3345 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pfdn1Q9CWM4 Soat1-201ENSMUST00000051396 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pfdn1Q9CWM4 Mcoln3-201ENSMUST00000039450 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pfdn1Q9CWM4 AC124579.1-201ENSMUST00000223468 2520 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pfdn1Q9CWM4 Hmcn1-202ENSMUST00000137197 16554 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pfdn1Q9CWM4 Zfp457-201ENSMUST00000049705 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pfdn1Q9CWM4 Stra6l-202ENSMUST00000107782 4009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pfdn1Q9CWM4 Gm21985-201ENSMUST00000141047 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pfdn1Q9CWM4 Mbnl2-202ENSMUST00000167459 4534 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pfdn1Q9CWM4 Slamf1-201ENSMUST00000015460 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pfdn1Q9CWM4 Iqub-201ENSMUST00000052277 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pfdn1Q9CWM4 Rgsl1-203ENSMUST00000141249 1752 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pfdn1Q9CWM4 Mir711-201ENSMUST00000102188 82 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pfdn1Q9CWM4 Gm3618-201ENSMUST00000112726 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Pfdn1Q9CWM4 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pfdn1Q9CWM4 Gm15217-202ENSMUST00000141358 347 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pfdn1Q9CWM4 Gm13944-202ENSMUST00000146495 542 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pfdn1Q9CWM4 Gm22795-201ENSMUST00000157233 118 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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Pfdn1Q9CWM4 Arpp19-204ENSMUST00000167885 540 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pfdn1Q9CWM4 Gm17059-201ENSMUST00000168284 519 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pfdn1Q9CWM4 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pfdn1Q9CWM4 1110032A03Rik-209ENSMUST00000177546 647 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Pfdn1Q9CWM4 1700016L21Rik-201ENSMUST00000187497 394 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pfdn1Q9CWM4 1700021A07Rik-202ENSMUST00000187763 485 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pfdn1Q9CWM4 1700025K24Rik-201ENSMUST00000190635 740 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pfdn1Q9CWM4 Gm37214-201ENSMUST00000192860 916 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pfdn1Q9CWM4 Gm38337-201ENSMUST00000193986 599 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pfdn1Q9CWM4 Gm31243-202ENSMUST00000198354 628 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pfdn1Q9CWM4 Igkv8-22-201ENSMUST00000199501 367 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pfdn1Q9CWM4 Gm4536-201ENSMUST00000209157 542 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pfdn1Q9CWM4 Ctxn3-203ENSMUST00000209786 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Pfdn1Q9CWM4 Gm18504-201ENSMUST00000220917 929 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pfdn1Q9CWM4 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pfdn1Q9CWM4 AL590616.1-201ENSMUST00000223339 574 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pfdn1Q9CWM4 Tpbpb-202ENSMUST00000223698 746 ntAPPRIS P2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pfdn1Q9CWM4 Gzma-202ENSMUST00000224282 996 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pfdn1Q9CWM4 AC163667.1-201ENSMUST00000225201 1289 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pfdn1Q9CWM4 AC134869.2-201ENSMUST00000225788 421 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pfdn1Q9CWM4 CT009550.3-201ENSMUST00000228542 455 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pfdn1Q9CWM4 Gm25259-201ENSMUST00000083048 193 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pfdn1Q9CWM4 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pfdn1Q9CWM4 Cst7-201ENSMUST00000089200 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pfdn1Q9CWM4 Gm21541-201ENSMUST00000098128 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pfdn1Q9CWM4 Hist1h2bb-201ENSMUST00000099703 508 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pfdn1Q9CWM4 Gm3259-202ENSMUST00000160045 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pfdn1Q9CWM4 C87414-201ENSMUST00000076321 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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