Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Unc80-206ENSMUST00000212557 9777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm37429-201ENSMUST00000193807 1799 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 St18-212ENSMUST00000151281 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Csde1-201ENSMUST00000029446 4318 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Vmn2r57-201ENSMUST00000165029 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Trappc13-206ENSMUST00000179891 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Il15ra-210ENSMUST00000128156 1624 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 AC129308.2-203ENSMUST00000224109 2385 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10259-201ENSMUST00000091289 1590 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm20597-201ENSMUST00000218774 5486 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Huwe1-201ENSMUST00000026292 14579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Tsix-201ENSMUST00000152916 4306 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Hspg2-203ENSMUST00000171332 14176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm42549-201ENSMUST00000202392 7004 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10307-201ENSMUST00000189839 1337 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 5830416I19Rik-201ENSMUST00000198687 2627 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Zim3-202ENSMUST00000203365 3226 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm25083-201ENSMUST00000102319 92 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Igkv1-122-201ENSMUST00000103314 383 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Ighv1-84-201ENSMUST00000103551 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm23485-201ENSMUST00000104181 155 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26417-201ENSMUST00000104274 135 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Vgll1-202ENSMUST00000114745 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12306-201ENSMUST00000117256 171 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm14158-201ENSMUST00000118409 308 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm14869-201ENSMUST00000119007 884 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Rapgef4os1-201ENSMUST00000126462 638 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15123-201ENSMUST00000138988 339 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10157-201ENSMUST00000139408 343 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13629-202ENSMUST00000152740 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15819-201ENSMUST00000153089 481 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm23639-201ENSMUST00000175078 132 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Fam47e-207ENSMUST00000176621 746 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Prh1-203ENSMUST00000177523 993 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm8245-201ENSMUST00000182434 987 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 1500004A13Rik-207ENSMUST00000184640 610 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm28991-201ENSMUST00000186584 543 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Smpx-208ENSMUST00000190091 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm3841-201ENSMUST00000191399 451 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm38373-201ENSMUST00000192042 288 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 4930566N20Rik-201ENSMUST00000195173 1199 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm8539-201ENSMUST00000199822 501 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm43040-201ENSMUST00000202399 558 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm44613-201ENSMUST00000205637 877 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm33248-201ENSMUST00000205836 617 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm44613-202ENSMUST00000205962 691 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm31045-201ENSMUST00000211266 922 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm30239-201ENSMUST00000220776 780 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Tbca-204ENSMUST00000220825 497 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 AC139941.1-201ENSMUST00000221517 478 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 AC132590.1-201ENSMUST00000224374 1164 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 AC134869.2-201ENSMUST00000225788 421 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 AC154380.1-201ENSMUST00000226804 720 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Tti1-201ENSMUST00000029179 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Ikzf5-201ENSMUST00000046306 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp263-207ENSMUST00000162207 2452 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Stra6l-201ENSMUST00000030011 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Sec24c-202ENSMUST00000223751 4196 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Triqk-203ENSMUST00000183345 3545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Impg2-204ENSMUST00000160116 3992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Mageb18-202ENSMUST00000113955 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 1700014D04Rik-203ENSMUST00000180139 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Prdm11-202ENSMUST00000111274 11678 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Slc25a40-202ENSMUST00000170496 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Mtrr-201ENSMUST00000045827 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Zc4h2-202ENSMUST00000119640 2075 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 9930111J21Rik2-201ENSMUST00000093152 2403 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 9930111J21Rik1-201ENSMUST00000093153 2403 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Trps1-204ENSMUST00000183757 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Stab2-201ENSMUST00000035288 8228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 AC139941.2-201ENSMUST00000221565 1824 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Prkacb-203ENSMUST00000106137 4061 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm6493-201ENSMUST00000159889 1786 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 AC153143.1-201ENSMUST00000222966 1340 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm29379-201ENSMUST00000186305 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm28276-201ENSMUST00000188508 2166 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm28201-201ENSMUST00000189989 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm37410-201ENSMUST00000193623 3039 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gip-201ENSMUST00000103156 607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Igkv2-137-201ENSMUST00000103302 501 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Trav13n-4-201ENSMUST00000103634 267 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm17184-201ENSMUST00000111864 462 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11263-201ENSMUST00000121853 749 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Mir1930-201ENSMUST00000158799 84 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 2810442N19Rik-202ENSMUST00000161583 919 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Mir6972-201ENSMUST00000184774 64 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 4930556G22Rik-201ENSMUST00000185689 741 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm4785-201ENSMUST00000191025 751 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Pilrb2-202ENSMUST00000196162 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm43964-201ENSMUST00000203570 301 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm31374-202ENSMUST00000214913 914 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm32443-201ENSMUST00000217880 707 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10126-201ENSMUST00000221732 168 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Stat4-201ENSMUST00000027277 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Cypt4-201ENSMUST00000053956 629 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms